スパコンによる遺伝子の仕組みのシミュレーション

まず、たとえば人間の遺伝情報は３０億の塩基対からなる。
A,T,C,G（２０個のアミノ酸から生成されている）の４文字の対からなるこれが生命の設計図ゲノムである。
１９９０年には１３年かかってこれを解析した。
数年後には一日で、ひょっとして１０万円でゲノムを調べられる。
しかし全遺伝子の機能はまだわかっているわけではない。
さて問題はがん細胞の生成の解明である。
そのためにはスパコンが必要となる、つまり情報工学が。神戸市に建設中の次世代スパコン京（けい）をもってしても実用にはまだ遠いが、
一つ例示すると：
がん細胞に抗がん剤パクリタキセルを投与、細胞内にある２万の遺伝子の活動の様子を２４時間、データに取った。
このデータを使い、抗がん剤がどう効いたのかをスパコンでシミュレーションした。
投与から１時間後、標的である遺伝子１が働き、別の遺伝子２が活性化。
その１時間後、２と連動して遺伝子３が活性化した。この３こそ、薬剤耐性関連遺伝子（パクリタキセルが効かない乳がん患者がもつ）であるので、ここまでの経路のどこかに作用して活性化を妨げる物質を見つけると治療につながる。
面白いのは、実験室でのデータだけであとは方程式を駆使してネットワークを描き出すのだが、そのシミュレーションの結果は、既知の医学、生物学の知識と合致するのである。
こういう「システムがん」研究は、旧来の手法では到達できない知識にまで到達することであろう。